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BSP甲基化測序
亞硫酸氫鹽處理后測序(bisulfite sequencing PCR,BSP)法是檢測基因甲基化的經典方法,其原理為:用亞硫酸氫鈉修飾處理基因組DNA,所有未發生甲基化的胞嘧啶(C)被轉化為尿嘧啶(U)而甲基化的胞嘧啶則不變。
基因組DNA經亞硫酸鹽處理后,設計BSP引物擴增目的片段,此時尿嘧啶(U)全部轉化為胸腺嘧啶(T),最后對PCR產物進行測序就可以判斷CpG位點是否發生甲基化。
技術優勢
(1) 檢測序列長,可長達200-400bp
(2) 分辨率高,可檢測到每一個堿基的甲基化狀況
(3) 對于樣品要求低,適用于新鮮、冷凍和FFPE樣本
服務內容
1. 基因組DNA的Bisulfite轉化;
2. BSP(Bisulfite Sequencing PCR)法,包括引物設計與合成,TA克隆測序及數據分析。
樣品要求
(1) 若提供基因組DNA,需≥2μg
(2) 若提供的材料為新鮮組織、血液、細胞等生物材料,請提供足夠提取2μg以上基因DNA的材料量
(3) 基于所選擇的DNA甲基化檢測方法,請提供相應的引物或引物序列
BSP服務完成時提供
(1) Bisulfite處理的基因組DNA
(2) 實驗報告(包括BSP產物的直接測序報告)
(3) 5個有效的陽性克隆
(4) 空點圖
結果展示
BSP測序圖
BSP點狀圖和BSP序列比對
BSP柱狀圖