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全基因組測序
來源：萬物生物 發(fā)布時間：2021-11-02
全基因組測序
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。 1986年， Renato Dulbecco是最早提出人類基因組測序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列，對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部（DOE）與美國國家衛(wèi)生研究院（NIH），分別在1986年與1987年加入人類基因組計劃。除了美國之外，日本在1981年就已經(jīng)開始研究相關問題，但是并沒有美國那樣積極。到了1988年，詹姆士·華生（DNA雙螺旋結構發(fā)現(xiàn)者之一）成為NIH的基因組部門主管。1990年開始國際合作。1996年，多個國家召開百慕達會議，以2005年完成測序為目標，分配了各國負責的工作，并且宣布研究結果將會及時公布，并完全免費。
應用領域
(1) 全基因組范圍內多性狀的定位；
(2) 目標性狀的生物學基礎研究。
產(chǎn)品優(yōu)勢
(1) 高通量檢測全基因組SNP并進行關聯(lián)分析，掃除定位盲點；
(2) 重重篩選SNP，多重檢驗顯著性，保證結果準確性；
(3) 同時對多種性狀進行定位；
(4) 定位精度最多可達單基因水平。
標準信息分析
(1) 已有參考基因組序列的動植物自然群體；
(2) 樣本間無明顯的亞群分化（如生殖隔離等）；
(3) 所研究表型性狀遺傳力較強。
(4) ≥200個樣本；
(5) 基于SNP：≥5 X/個體；
(6) 基于CNV：≥30X/個體 10~20W Tags；
(7) 平均8 X/Tag；
(8) 測序數(shù)據(jù)質量評估；
(9) 與參考基因組比對；
(10) SNP、CNV檢測及注釋 SNP檢測及注釋；
高級信息分析
(1) 構建系統(tǒng)進化樹；
(2) 群體主成分分析；
(3) 連鎖不平衡分析；
(4) 性狀關聯(lián)分析；
(5) 目標性狀相關區(qū)域基因功能注釋；
(6) 構建單體型圖譜。
樣品要求
(1) 樣品類型：基因組DNA；
(2) 樣品需求量：單次2 ug；
(3) 樣品濃度：文庫≥30 ng/μl；
(4) 樣品純度：OD260/280為1.8-2.0；
(5) 電泳要求：主帶清晰，無降解或輕度降解。（距送樣日最近的電泳結果）
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